婴儿便秘原因之一：饮食不足
如果家长喂养不合理，宝宝吃得不够，食物消化后液体消化残留物较少，可能会导致宝宝排便量变少、变稠。当牛奶中糖分不足时，胃肠功能就会减弱，大便就会变得干硬。长期饮食不足，导致营养缺乏，腹部、肠道肌肉力量减弱，甚至收缩、收缩力减弱，形成恶性循环，加重宝宝严重便秘。
婴儿便秘原因之二：食物成分不合理
食物成分与排便密切相关。如果食物中含有大量蛋白质而碳水化合物不足，肠道细菌就会发生二次变化，肠道内容物的发酵过程就会减少，排便就会趋于碱性和干燥；如果食物中碳水化合物含量较多，则胃肠道发酵菌增多，发酵效果提高，产生的酸较多，排便更酸、更频繁、更软；如果脂肪和碳水化合物摄入量高，排便无益。如果吃得多，OPO结构脂稠化，你的排泄物中就会含有过多的不溶性钙皂，这会增加你的排泄量，导致严重的便秘。含有碳水化合物的米糊和小麦粉食品比谷物食品更容易引起便秘。孩子们很挑食。许多孩子喜欢吃肉，少吃或不吃蔬菜。食物中甲基纤维素太少也容易导致严重便秘。
造成婴儿便秘的第三大原因：胃肠功能紊乱
如果宝宝没有养成规律的生活方式，缺乏按时排便的训练，缺乏排便的条件刺激也是严重便秘的常见原因。另外，学龄前儿童往往没有早上排便的习惯，在学习时间也不能随时排便。上课时忍住排便也是严重便秘的常见原因。常见的泻药或清洁灌肠、活动精神不振，或慢性疾病如：缺乏营养、佝偻病、高钙血症、多发性肌炎、克汀病、先天性肌无力等，都是由肠肌无力引起的。功能紊乱和严重便秘。中枢神经系统功能紊乱、腹部肌肉无力或麻木也常导致排便不顺畅。服用某些药物会降低胃肠功能并引起严重便秘，例如抗胆碱能药物、抗酸剂、某些抗惊厥药、利尿剂和铁补充剂。
婴儿便秘的第四个原因：身体素质和生理异常
婴儿患有某些疾病，如肛裂、肛门狭窄、先天性巨结肠、脊柱裂，或者恶性肿瘤挤压马尾辫等，都可能导致婴儿严重便秘。应进行直肠指检、下脊柱和会阴检查。有些患者在出生后会出现严重的便秘。如果有家族史，很可能与基因遗传有关。
婴儿便秘的第五个原因：精神因素
有些宝宝受到突然的精神刺激，或者环境、生活方式的突然改变，都会在短期内导致宝宝出现严重的便秘。